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FICHE EXAMEN
COPROCULTURE
Révisé le 09/06/2023 12:23:17
EXAMEN
Nom d'examenCOPROCULTURE
SpécialitéBACTÉRIOLOGIE
Synonyme (s)EXAMEN MICROBIOLOGIQUE DE​S MATIÈRES FÉCALES, EXAMEN MICROBIOLOGIQUE DES SELLES
SALMONELLE
SHIGELLE
CAMPYLOBACTER
YERSINIA
SHU
Principales indicationsDiagnostic des diarrhées aigues d'orignie infectieuses
Rechercher et identification des Salmonelles, Shigelles, Campylobacter, Yersinia.
Laboratoire exécutant
LABORATOIRE CH DE CHOLET
PRE ANALYTIQUE
Bon de demandeImprimé bleu : Bactériologie - Parasitologie
Nature de l'échantillon biologiqueSelles
Matériel de prélèvement
x1Flacon stérile pour recueil de selles
Quantité minimaleUne noix de selles (un échantillon mucopurulent ou sanglant est privilégié lorsqu’il en existe)
Conditions d'acheminement au laboratoire< 2 heures, à température ambiante
< 24 heures si conservation entre 2-8°C
ANALYTIQUE
Critères d'acceptation pour un rajout d'examen, examen(s) cumulable(s)- Rotavirus, adénovirus, norovirus (possible jusqu'à 48 heures après le prélèvement conservé à +4°C)
- Clostridum difficile (possible jusqu'à 12 heures après le prélèvement conservé à +4°C)
fréquence de réalisation de l'examenDu lundi au samedi en dehors des périodes de garde
Méthode analytique utilisée-PCR + culture +/- antibiogramme
- PCR sur BDmax en 1ère intention pour dépister les bactéries responsables des gastro-entérites dues aux Salmonella Spp, Campylobacter (jéjuni et coli), Shigella Spp / EIEC, shigatoxines 1/2 présentes chez les E.Coli producteurs de shigatoxines.
- si le test est positif, une mise en culture de la selle est réalisée afin d'obtenir la souche et l'antibiogramme.
- mise en culture systématique pour la recherche de Yersinia.
- si le test est négatif, la reprise du prélèvement peut être faite à la demande du clinicien si recherche de pathogènes non détectés dans le panel.
POST ANALYTIQUE
Delai de rendu des résultats48h à 72h
Délai de conservation par le laboratoireUne semaine à +4°C
INFORMATIONS/RENSEIGNEMENTS
Fiche Technique
Documents associés-Fiche technique: Réalisation d'un prélèvement de selles
Instructions complémentairesRéaliser le prélèvement si possible avant le début de l'
antibiothérapie.
La prescription d'une seule coproculture est en général suffisante.


Renseignements cliniques souhaités : début des signes cliniques, fièvre, diarrhées sanglantes, antibiothérapie, hospitalisation > 48 h, immunodépression, contexte de SHU, contexte de voyage/retour de pays tropical, TIAC, ingestion de fruits de mer...

Bien spécifier sur le bon de demande (Cf fiche spécifique) si recherche de:
- Clostridium difficile
- Rotavirus
- Adenovirus
- Norovirus
- Escherichia coli entérohémorragique (EHEC) (envoi au CNR)
- Vibrio cholerae
- Parasitologie des selles
- autres pathogènes que ceux habituellement recherchés (Aeromonas, Plesiomonas ...)
Recommandations pour la réalisation du prélèvementMatériels :
-Gants à usage unique non stériles
-Récipients propre
-Pot stérile avec spatule (bouchon rouge)

Recommandation :
-Ne jamais récupérer les selles dans la cuvette des toilettes
-Ne pas souiller les selles avec des urines

Comment prélever ?
-Recueillir les selles dès émission dans un récipient propre
-Transférer les selles à l’aide de la spatule fournie dans le pot stérile
-Privilégiez les zones muco-sanglantes si elles existent
-Remplir le pot au 1/3 environ
-Refermez soigneusement le pot
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